O'zbekiston Respublikasi Bosh vaziri tomonidan 2002 yil 19 sentyabrda tasdiqlangan ISO 9001: 2000 xalqaro standartining talablariga muvofiq Sifat Menejmenti Tizimini ishlab chiqish, tadbiq etish va sertifikatlash bosqichma bosqich dasturiga muvofiq, korxonamizda sifat menejmenti tizimi joriy etilib, sertifikatlangan. Tizim 2007 yil 10-sentabrda TUV SERT (Germaniya) xalqaro sertifikatlash organi tomonidan "SERT MANAGEMENT" AJ bilan birga MChJ auditorlari ishtirokida sertifikatlangan. Sertifikat mineral o'g'itlar va defoliantlar ishlab chiqarish uchun amalda bo'lgan.
MST faoliyatining tajribasiga va korxonalarning ekologik jihatdan tobora ortib borayotgan talablariga muvofiq, korxonamiz rahbariyati korxonada ISO 9001 xalqaro standartiga muvofiq, ISO 9001 xalqaro standarti va 2004 yil ISO 14001 versiyasiga muvofiq atrof-muhit boshqaruvi tizimiga muvofiq sifat menejmenti tizimini o'z ichiga olgan yagona boshqaruv tizimini (MIT) ishlab chiqish va amalga oshirishga qaror qildi. Ushbu tizim 2011 yilda ishlab chiqilgan, joriy etilgan va muvaffaqiyatli sertifikatlangan. Tizimning rivojlanishi davrida, mineral o'g'itlar, defoliantlar va sellyuloza atsetatlarini ishlab chiqarish kengaytirilgan.
2013 yilda qayta sertifikatlashtirish bo'yicha audit o'tkazildi - sertifikatning haqiqiyligi Cert International tomonidan tasdiqlangan. ISO 9001: 2008, O'z DSt ISO 9001: 2009 va O'z DSt ISO 14001: 2009 xalqaro standartlari asosida yangi sertifikatlar olingan.
Korxonada ikkita sertifikatlangan laboratoriya mavjud:
- MKL reaktivlar va dorilarni tayyorlash sektori. 2010 yil 25 iyundan 25 iyungacha № 51 attestat guvohnomasi
- AM-76 laboratoriyasi. 2010 yil 25 iyundan 52 iyunga qadar № 52 Attestatsiya guvohnomasi va uchta akkreditlangan laboratoriyalar:
- Texnik nazorat bo’limining (TNB) akkreditatsiyalangan sinov laboratoriyasi - 2.05.2011 yil, UZ.AMT07.MAI.376, muddati cheklanmagan
- - SES akkreditatsiya sexi laboratoriyasi - 2.06.2009 yil UZ.AMT07.MAI.375, muddati cheklanmagan
- - Korxonaning metrologiya xizmati laboratoriyasi - 23.01.2012 yildagi 0169-sonli akkreditatsiya to'g'risidagi guvohnoma, muddati 23.01.2017 yilgacha
Laboratoriyalarni rivojlantirish bo'yicha uzoq muddatli rejalar ishlab chiqilib, bosqichma-bosqich amalga oshirilib kelinmoqda, shu jumladan, yangi uskunalarni sotib olish, mavjud va o'lchashning yangi usullarini ishlab chiqish va tadbiq etish, hamda mavjud va o’zlashtirilayotgan mahsulotni nazorat qilish amalga oshirilimoqda.
Korxonada uskunalarni modernizatsiyasi bosqichma-bosqich o’tkazilmoqda. 2007 yildan buyon, Ammiak-3 sexining avtomatlashtirilgan texnologik jarayonni boshqarish tizimi (ATJBT) almashtirilgan, bundan tashqari, ammiak ishlab chiqarish jarayoni takomillashtirildi – monoetanolamin absorbenti yanada ilg’or metildietanolaminga almashtirildi, shuningdek, Karbamid sexining ATJBTsi zamonaviysiga almashtirildi.
Korxonada yabgi turdagi mahsulotlar – Azot-fosforli o’g’it (AFU), Suyuq azotli mineral og’iti (KAS), natriy biokarbonati, Suyultirilgan azotli-kaltsiy og’iti (SAKO’) va boshqalar o’zlashtirildi.
SMTni amalga oshirishdan oldin korxonada ikkita turdagi mahsulot - karbamid va ammiakli selitrani sertifikatlagan edi, hozirda 13 turdagi mahsulot sertifikatlangan.
"Farg'onaazot" AJ korxonasiga Sifat Menejmenti Tizimini joriy etish mineral o'g'itlarni nafaqat yaqin, balki uzoq xorij mamlakatlariga ham eksport qilish geografiyasini kengaytirish imkonini berdi. Shunday qilib, 2007-2008 yillarda Rossiya, Qozog'istonga eksport qilindi. 2015-yilda 15 mamlakatga - Rossiya, Qozog'iston, Qirg'iziston, Malayziya, BAA, Koreya, Eron, Filippin, Turkiya, Litva, Moldova, Keniya, Kamerun, Shri Lanka, Yaponiyaga eksport qilishni tashkil etdi.
Korxonada SMT ning joriy etilishi va faoliyat ko'rsatishi davomida 250 dan ortiq xodimlar turli kurslarda o'qitildi. O’qitish korxona hududida ham, tashqarida (NIISMS, Sert Akademie, Uzbek-Holding, Farg'ona SSM va boshqalar)ham o'tkazilgan.